Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PNLDC1Q8NA58 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PNLDC1Q8NA58 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms