Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC155Q8N6L0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC155Q8N6L0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms