Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZRN4Q6ZMN7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms