Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00114Q6XXX2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms