Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSD17B12Q53GQ0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms