Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAPSNQ13702 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAPSNQ13702 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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