Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
OCA2Q04671 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OCA2Q04671 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms