Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATF1P18846 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATF1P18846 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATF1P18846 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms