Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNB1P01574 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms