Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG12O94817 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG12O94817 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG12O94817 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG12O94817 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms