Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFIT3O14879 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms