Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NICN1Q9BSH3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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