Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RDH12Q96NR8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms