Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM227BQ96M60 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms