Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BICD1Q96G01 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms