Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAVIN3Q969G5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAVIN3Q969G5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms