Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSGALNACT2Q8N6G5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSGALNACT2Q8N6G5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSGALNACT2Q8N6G5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSGALNACT2Q8N6G5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSGALNACT2Q8N6G5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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