Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPN12Q6ZSI9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms