Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms