Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTUD3Q5T2D3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms