Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD12Q587J7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TDRD12Q587J7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms