Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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LTC4SQ16873 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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LTC4SQ16873 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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LTC4SQ16873 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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LTC4SQ16873 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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LTC4SQ16873 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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LTC4SQ16873 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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LTC4SQ16873 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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LTC4SQ16873 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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LTC4SQ16873 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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LTC4SQ16873 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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LTC4SQ16873 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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LTC4SQ16873 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTC4SQ16873 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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