Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL3Q13618 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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