Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC20Q12834 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDC20Q12834 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC20Q12834 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC20Q12834 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDC20Q12834 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC20Q12834 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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