Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms