Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SCN2BO60939 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SCN2BO60939 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SCN2BO60939 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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SCN2BO60939 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCN2BO60939 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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