Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MAP3K13O43283 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MAP3K13O43283 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms