Protein–RNA interactions for Protein: V9GYS6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYS6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
V9GYS6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
V9GYS6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
V9GYS6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
V9GYS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
V9GYS6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYS6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYS6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYS6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYS6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
V9GYS6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYS6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYS6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
V9GYS6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYS6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
V9GYS6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
V9GYS6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
V9GYS6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GYS6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GYS6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GYS6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GYS6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GYS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
V9GYS6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GYS6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GYS6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GYS6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
V9GYS6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GYS6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GYS6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GYS6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
V9GYS6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYS6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYS6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYS6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYS6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYS6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYS6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYS6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
V9GYS6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GYS6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
V9GYS6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GYS6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
V9GYS6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
V9GYS6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
V9GYS6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYS6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYS6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYS6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYS6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYS6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYS6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYS6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
V9GYS6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
V9GYS6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
V9GYS6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYS6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYS6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYS6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYS6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYS6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYS6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYS6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYS6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYS6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
V9GYS6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYS6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYS6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYS6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYS6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYS6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYS6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
V9GYS6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GYS6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GYS6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GYS6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GYS6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GYS6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GYS6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GYS6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
V9GYS6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
V9GYS6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
V9GYS6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
V9GYS6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
V9GYS6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
V9GYS6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V9GYS6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V9GYS6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
V9GYS6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
V9GYS6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
V9GYS6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GYS6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GYS6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GYS6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GYS6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
V9GYS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
V9GYS6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
V9GYS6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
V9GYS6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
V9GYS6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms