Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LINC01558Q9Y6Z2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01558Q9Y6Z2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC01558Q9Y6Z2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms