Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CAMTA1Q9Y6Y1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CAMTA1Q9Y6Y1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CAMTA1Q9Y6Y1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CAMTA1Q9Y6Y1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CAMTA1Q9Y6Y1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CAMTA1Q9Y6Y1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CAMTA1Q9Y6Y1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CAMTA1Q9Y6Y1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CAMTA1Q9Y6Y1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CAMTA1Q9Y6Y1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CAMTA1Q9Y6Y1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CAMTA1Q9Y6Y1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CAMTA1Q9Y6Y1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CAMTA1Q9Y6Y1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CAMTA1Q9Y6Y1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CAMTA1Q9Y6Y1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CAMTA1Q9Y6Y1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CAMTA1Q9Y6Y1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CAMTA1Q9Y6Y1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms