Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6E7

SIRT4, NAD-dependent protein lipoamidase sirtuin-4, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT4Q9Y6E7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIRT4Q9Y6E7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIRT4Q9Y6E7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIRT4Q9Y6E7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIRT4Q9Y6E7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIRT4Q9Y6E7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms