Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP4B1Q9Y6B7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP4B1Q9Y6B7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AP4B1Q9Y6B7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP4B1Q9Y6B7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms