Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E2

PCDHB7, Protocadherin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB7Q9Y5E2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHB7Q9Y5E2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB7Q9Y5E2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB7Q9Y5E2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB7Q9Y5E2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB7Q9Y5E2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB7Q9Y5E2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB7Q9Y5E2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB7Q9Y5E2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB7Q9Y5E2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB7Q9Y5E2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB7Q9Y5E2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB7Q9Y5E2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB7Q9Y5E2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB7Q9Y5E2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB7Q9Y5E2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB7Q9Y5E2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHB7Q9Y5E2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB7Q9Y5E2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB7Q9Y5E2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB7Q9Y5E2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB7Q9Y5E2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB7Q9Y5E2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms