Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Z2

NEUROG3, Neurogenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROG3Q9Y4Z2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEUROG3Q9Y4Z2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEUROG3Q9Y4Z2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEUROG3Q9Y4Z2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEUROG3Q9Y4Z2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROG3Q9Y4Z2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms