Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
KLF12Q9Y4X4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLF12Q9Y4X4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF12Q9Y4X4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms