Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBE2J1Q9Y385 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2J1Q9Y385 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2J1Q9Y385 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms