Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR3KQ9Y2Y1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3KQ9Y2Y1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR3KQ9Y2Y1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3KQ9Y2Y1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms