Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NINLQ9Y2I6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NINLQ9Y2I6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NINLQ9Y2I6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NINLQ9Y2I6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NINLQ9Y2I6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NINLQ9Y2I6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NINLQ9Y2I6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NINLQ9Y2I6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
NINLQ9Y2I6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NINLQ9Y2I6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NINLQ9Y2I6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NINLQ9Y2I6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.26
NINLQ9Y2I6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NINLQ9Y2I6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NINLQ9Y2I6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms