Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SBNO2Q9Y2G9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SBNO2Q9Y2G9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SBNO2Q9Y2G9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SBNO2Q9Y2G9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SBNO2Q9Y2G9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SBNO2Q9Y2G9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SBNO2Q9Y2G9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SBNO2Q9Y2G9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SBNO2Q9Y2G9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SBNO2Q9Y2G9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SBNO2Q9Y2G9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SBNO2Q9Y2G9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SBNO2Q9Y2G9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SBNO2Q9Y2G9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SBNO2Q9Y2G9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SBNO2Q9Y2G9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SBNO2Q9Y2G9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SBNO2Q9Y2G9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SBNO2Q9Y2G9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SBNO2Q9Y2G9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SBNO2Q9Y2G9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SBNO2Q9Y2G9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SBNO2Q9Y2G9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SBNO2Q9Y2G9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SBNO2Q9Y2G9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SBNO2Q9Y2G9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
SBNO2Q9Y2G9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SBNO2Q9Y2G9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SBNO2Q9Y2G9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SBNO2Q9Y2G9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SBNO2Q9Y2G9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SBNO2Q9Y2G9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms