Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POMPQ9Y244 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POMPQ9Y244 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMPQ9Y244 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
POMPQ9Y244 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms