Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHOC2Q9UQ13 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHOC2Q9UQ13 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHOC2Q9UQ13 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHOC2Q9UQ13 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
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