Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW0

TPX2, Targeting protein for Xklp2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPX2Q9ULW0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TPX2Q9ULW0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TPX2Q9ULW0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TPX2Q9ULW0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TPX2Q9ULW0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPX2Q9ULW0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TPX2Q9ULW0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPX2Q9ULW0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TPX2Q9ULW0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TPX2Q9ULW0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPX2Q9ULW0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TPX2Q9ULW0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms