Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PNMA8BQ9ULN7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA8BQ9ULN7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA8BQ9ULN7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNMA8BQ9ULN7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms