Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGA11Q9UKX5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGA11Q9UKX5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA11Q9UKX5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ITGA11Q9UKX5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGA11Q9UKX5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms