Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DDX41Q9UJV9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
DDX41Q9UJV9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX41Q9UJV9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DDX41Q9UJV9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX41Q9UJV9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DDX41Q9UJV9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX41Q9UJV9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DDX41Q9UJV9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX41Q9UJV9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX41Q9UJV9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX41Q9UJV9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX41Q9UJV9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX41Q9UJV9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX41Q9UJV9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX41Q9UJV9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX41Q9UJV9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX41Q9UJV9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX41Q9UJV9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX41Q9UJV9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX41Q9UJV9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX41Q9UJV9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX41Q9UJV9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX41Q9UJV9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
DDX41Q9UJV9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX41Q9UJV9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX41Q9UJV9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms