Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCP2D1Q9UJQ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCP2D1Q9UJQ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCP2D1Q9UJQ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms