Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPN3Q9UHW5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPN3Q9UHW5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPN3Q9UHW5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPN3Q9UHW5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPN3Q9UHW5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms