Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MTRF1LQ9UGC7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTRF1LQ9UGC7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTRF1LQ9UGC7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTRF1LQ9UGC7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTRF1LQ9UGC7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTRF1LQ9UGC7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTRF1LQ9UGC7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTRF1LQ9UGC7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTRF1LQ9UGC7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTRF1LQ9UGC7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTRF1LQ9UGC7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MTRF1LQ9UGC7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MTRF1LQ9UGC7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MTRF1LQ9UGC7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTRF1LQ9UGC7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms