Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM10Q9UDY6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM10Q9UDY6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM10Q9UDY6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM10Q9UDY6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM10Q9UDY6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM10Q9UDY6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM10Q9UDY6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM10Q9UDY6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM10Q9UDY6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM10Q9UDY6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM10Q9UDY6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM10Q9UDY6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM10Q9UDY6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM10Q9UDY6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM10Q9UDY6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM10Q9UDY6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM10Q9UDY6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM10Q9UDY6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM10Q9UDY6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM10Q9UDY6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM10Q9UDY6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM10Q9UDY6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM10Q9UDY6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM10Q9UDY6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM10Q9UDY6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM10Q9UDY6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM10Q9UDY6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM10Q9UDY6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 304.1 ms