Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPASTQ9UBP0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPASTQ9UBP0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPASTQ9UBP0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPASTQ9UBP0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPASTQ9UBP0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPASTQ9UBP0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPASTQ9UBP0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPASTQ9UBP0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPASTQ9UBP0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPASTQ9UBP0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPASTQ9UBP0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPASTQ9UBP0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPASTQ9UBP0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPASTQ9UBP0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPASTQ9UBP0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPASTQ9UBP0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms